Sankara, 1949`da o zamanki adıyla Yukarı Volta`da dünyaya geldi. Fas, Fransa ve Madagaskar`da subay olarak eğitim gördükten sonra 1980 yılında Albay Saye Zerbo`nun yönetimindeki askeri darbeye katıldı. Hükümette devlet bakanlığı kazanan Sankara kısa süre sonra solcu görüşleri nedeniyle görevden alındı. 7 Kasım 1982`de Jean-Baptiste Ouí©draogo`nun yönetiminde yapılan darbe sonucu başbakanlık görevini üstlenen Sankara Mayıs ayında başka önde gelen isimlerle birlikte görevinden uzaklaştırıldı ve ev hapsine alındı. Bu kitle eylemlerine neden oldu. Blaise Compaorí©`nin Ağustos 1983`te gerçekleştirdiği yeni bir darbeyle Sankara devlet başkanlığı görevini üstlendi. Ülkenin ekonomik ve kültürel kalkınmasına yönelik giriştiği kampanyayla ve bireysel çıkarlar peşinde koşmayışıyla uluslarası bir prestij kazandı. Küba modelinden ve Ghana devlet başkanı Jerry Rawling`ten etkilendi. Planlı ekonomi aracılığıyla sosyalist bir kalkınma modeli uygulayarak ülkeyi yoksulluktan kurtarmaya çalıştı. Çok sayıda kadının da hükümette olduğu Sankara döneminde, kadın hakları konusunda da önemli adımlar atıldı. Kadın sünnetini yasakladı, çok eşliliğe karşı çıktı ve doğum kontrolünün yaygınlaştırılmasını savundu. AIDS`i Afrika için büyük bir tehdit olarak gören ilk devlet Burkina Faso oldu. 1984 yılında ülkenin Yukarı Volta olan adı Burkina Faso olarak değişti. Yeni bir bayrak ve ulusal marş kabul edildi. Ancak Sankara`nın çabalarına karşın ekonomik hayatta önemli bir düzelme olmadı.
Hoşnutsuzluğun artması sonucu 15 Ekim 1987`de Blaise Compaorí©`nin yönetiminde yeni bir darbe gerçekleştirildi. Darbe sırasında çıkan çatışmalarda Sankara da darbeciler tarafından öldürüldü.