(D.1953, Adapazarı) doğumlu. 1975 yılında Atatürk Üniversitesi, Edebiyat Fakültesi Türk Dili ve Edebiyatı Bölümünden mezun oldu. Görevleri arasında Ahmet Yesevi Uluslararası Türk-Kazak Üniversitesi Sosyal Bilimler Enstitüsü`nde müdürlük, Gazi Üniversitesi Fen Edebiyat Fakültesi Türk Dili ve Edebiyatı Bölümünde Bölüm Başkanlığı yaptıktan sonra Gazi Üniversitesi Fen-Edebiyat Fakültesi dekanı oldu (1997). 2000 yılında Başkent Üniversitesi`ne geçti ve burada Türk Dili ve Edebiyatı Bölümünü kurdu.
17 Aralık 2002 tarihinde Kültür Bakanlığı Müsteşarlığına atandı. Kültür ve Turizm Bakanlıklarının birleşmesi sonucu 17.6.2003 tarihinde Kültür ve Turizm Bakanlığı Müsteşarlığına tayin edildi. Prof. Dr. İsen`in Türk Edebiyatı ve Balkanlarda Türk kültürü ile ilgili yayınlanmış çok sayıda çalışması var.
İsen, 22 Temmuz seçimlerinde milletvekili adaylığı için müsteşarlıktan istifa etti. Ancak AK Parti listesine konulmadı. Mustafa İsen 5 Temmuz`da da müsteşarlık görevine döndü.
Abdullah Gül Cumhurbaşkanlığa seçilmesinin ardından Prof.Dr. Mustafa İsen`i Cumhurbaşkanlığı Genelsekreterliğine atadı.
Türk-biyo-taslak