Markko Märtin (d. 10 Kasım 1975, Tartu) Estonyalı ralli sürücüsü. 1997 senesinde Toyota takımında kariyerine başladı. Co-Pilotu ise Michael Park'tı. 2000 senesinde Subaru takımına geçti. 2002'de Ford takımınında 3. pilot oldu. 2003'te Colin McRae ve Carlos Sainz'in Ford'dan Citroen'e geçmeleri sonucu takımın 1. pilotu oldu. 2005'te Peugeot takımına geçti. Co-Pilot'u Michael Park'ın 2005 Galler Rallisi'nde ağaca çarpmaları sonucu ölmesi nedeniyle kariyerini bıraktı. Dünya Ralli Şampiyonası'nda 5 yarış kazandı.