1980'lerde Bilim ve Sanat ile Yarın dergilerinde yazdı, Yarın'ın yayın kurulunda yer aldı.
ANKA'nın ardından Hasan Cemal'in genel yayın yönetmenliğindeki Cumhuriyet gazetesine geçti ve her iki kurumda toplam yedi yıl diplomasi muhabirliği yaptı.
Bu dönemde Birinci Körfez Savaşı ve Doğu Avrupa ülkelerindeki sosyalist rejimlerin yerini demokrasilere bırakması başta olmak üzere birçok önemli gelişmeyi yerinde izledi.
Cumhuriyet'ten ayrıldıktan sonra, BBC Dünya Servisi'nin Londra'daki merkezinde radyo prodüktörü olarak çalıştı.
İstanbul'da, Strateji-Mori araştırma kurumunun siyasi araştırmalardan sorumlu başkan yardımcılığını yaptı.
Yeni Yüzyıl gazetesini hazırlayan kadroda yer alırken, Ocak 1995'te Milliyet'in Washington Temsilcisi oldu. Milliyet'te her Pazartesi 'Yıldızlar, Çizgiler ve Ötesi' başlıklı sütununda Amerikan politikaları ile bunların Türkiye ve bölgesine etkisi konusunda yoğunlaşan yazılar yazıyor.
Daha önce ABD'den Kanal D için haber ve röportajlar yapan Çongar, kuruluşundan bu yana CNN TÜRK'ün Washington Temsilcisi. Haziran 2006'dan beri ABD başkentinde çekilen 'Burası Washington' adlı tartışma programını hazırlıyor ve sunuyor.
2006'da 'Perspektif' programı için, Afganistan'ın son beş yılını anlatan "Umudun Zorlandığı Ülke" belgeselini hazırladı.
Çongar, 2002'den beri anne.