1)Yüksek Sıcaklıklarda Yakarak İmha Bu sistem eskiden beri kullanılan yöntemdir, atıklar tamamen yok edilirler, bunlar incinerator denen cihazlarda 900 oC sıcaklıkta yakılırlar çıkan gazlar tekrar 1200 oC sıcaklıkta 0.5-2 sn boyunca yakılırlar çıkan gazlar çeşitli filtre sistemlerinden geçirilerek çevreyi kirletmeyecek emisyon değerlerine getirilirler.bakınız [1]
2) Gömme Türkiyede birkaç şehirde uygulanan ilkel bir sistemdir. Atıklardan çıkan sıvılar yeraltı sularına karışarak çeşitli hastalıklara neden olduğundan kullanışlı değillerdir. Tuz havzalarında derine gömme yöntemide kullanılan bir yöntemdir.
3 Sterilizasyon Enfekte atıkları steril etmek için kullanılan birçok değişik yöntem vardır ancak sonuçta katı atıklar yok olmadığından yine yakma sistemi kullanılmak zorunludur. Tüm tıbbi atıklar için geçerli bir yöntem değildir.