Protozooloji, protozoaları konu edinen bir öğrenim dalıdır.
protozoonların morfolojik ve biyolojik özelliklerini inceler. İlksel bir bilim dalı olan Protozooloji, patojen ve saprofit bütün protozoonları inceler. Bu bilim dalı ile birlikte ökaryotların gelişimi hakkında birçok bilgi edinilmiştir.
Yeryüzünde yaşayan tek hücreli canlılar; tek hücreli bitkiler (Protophyta) ve tek hücreli hayvanlar (Protozoa) olmak üzere ikiye ayrılırlar.