Ekim 1992’de Yakınçağ Tarihi Bilimdalı’nda “Doçent”, Mart 1998’de de “Profesör” oldu. Fakülte yönetiminin çeşitli kademelerinde görev aldı. Bölüm Bşk., Fakülte Kurulu Üyeliği görevlerinde bulundu. Aralık 1994’de “Dekan Yardımcılığı” görevine atandı ve bu görevi üç yıl sürdürdü. Bu arada değişik zamanlarda Dekanlığa vekalet etti. 1995’te Başbakanlık Atatürk Kültür, Dil ve Tarih Yüksek Kurumu Atatürk Araştırma Merkezi Bilim Kurulu Üyeliğine seçildi.
YÖK/ Dünya Bankası Milli Eğitimi Geliştirme Projesi çerçevesinde 1995 Yılından itibaren Sosyal Bilimler ve Tarih Öğretimi akademik çalışmalarında “Panelist” olarak görev aldı. Aynı proje çerçevesinde Tarih Öğretimi ve Öğretmen Yetiştirme Programları üzerine araştırma ve incelemelerde bulunmak üzere YÖK tarafından 1997 yılında İngiltere’ye gönderildi. Leeds Universitesi School of Education (Eğitim Fakültesi)’nde hazırlanan programa katıldı, İngiliz eğitim sistemi ve tarih öğretimi üzerine araştırma ve incelemelerde bulundu.
Prof. Dr. Nuri Köstüklü’nün Yakınçağ Türk Tarihi, T.C. Tarihi ve Tarih Öğretimi alanlarında yayınlanmış 7 kitabı ve milli ve milletlerarası kongrelerde sunulanlarla birlikte 50’nin üzerinde bildiri ve makalesi bulunmaktadır. Halen S.Ü.Eğitim Fakültesi Tarih Öğretmenliği Anabilim Dalı Başkanı ve Başbakanlık Atatürk Kültür Dil ve Tarih Yüksek Kurumu Atatürk Araştırma Merkezi Bilim Kurulu Üyesi olan Prof. Dr. Nuri Köstüklü, evli ve üç çocuk babası olup İngilizce ve Arapça bilmektedir.