Niko Kovač (d. 15 Ekim 1971), Hırvat eski millî futbolcu ve teknik direktör. 2002 FIFA Dünya Kupası'nda Hırvatistan millî futbol takımının formasını giyen oyuncu orta saha bölgesinde görev yapmıştır.
Profesyonel kariyerine 1990 yılında Hertha Zehlendorf kulübünde başladı. Daha sonra sırasıyla Hertha BSC II, Hertha Berlin, Bayer Leverkusen, Hamburg, Bayern Munich, Hertha Berlin, Red Bull Salzburg kulüplerinde oynadı.
8 Mart 2016 tarihinde Eintracht Frankfurt ile sözleşme imzaladı.