Aynı üniversitede tarih alanında yüksek lisansını tamamladıktan sonra yazarlık hayatına başladı.
Bir dönem ABD`de Akıllı tasarım (Intelligent Design) hareketinin öncülüğünü yürüten Discovery Institute bünyesinde çalışmalarını yürüttü. Din, bilim ve materyalizm gibi konularda ABD ve İngiltere`deki çeşitli üniversitelerde konferanslar verdi. 2005 mayısında ABD`nin Kansas Eyaleti Eğitim Bakanlığı`nda eğitim müfredatı değişikliği tasarısı konusunda "bilirkişi" olarak dinlendi. 15 Ekim 2005 den beri de AT hareketinin Discovery Instituteile birlikte iki öncü kuruluşundan biri olan Intelligent Design Network`ün (IDnet) yönetim kurulu üyesidir. IDnet`in direktörü John Calvert tarafından yayınlanan 15 Ekim 2005 tarihli basın bültenindeduyurulan karara göre, Akyol, kuruluşun on iki kişilik yönetim kurulunun ilk ve tek Müslüman üyesidir.
Çeşitli İslam karşıtı kalemler ile İslamiyet ve terörizm konusunda yürüttüğü entellektüel tartışma, Amerikan basınında önemli yankı buldu.
Halen ABD`deki çeşitli gazete ve düşünce dergilerinde, İslam dünyası, Türkiye, din, bilim ve toplumsal ahlak gibi konularda yazmaktadır. Akyol`un İngilizce yazılarının tümüne, İngilizce sitesi TheWhitePath `den , Türkçe yazılarının tümüne, Türkçe sitesi www.mustafaakyol.org dan ulaşabilirsiniz.
Mustafa Akyol`un Türk basınındaki çeşitli yazıları ise Radikal, Referans, Zaman ve Turkish Daily News gazetelerinde yayınlanmaktadır. Yazar ayrıca 2006 yılı içinde Kürt Sorununu Yeniden Düşünmek. Yanlış Giden Neydi? Bundan Sonra Nereye?isimli bir de kitap yayınlamıştır. Kitap Doğan Kitap tarafından yayınlanmıştır.
.jpg)