Musikiye Dr. Selahattin Tanur`la tanbur ve eser meşkederek başlayan Murat Bardakçı, Tanur`dan "icazet" aldı, Ekrem Karadeniz`le teori, teori tarihi ve ses sistemi üzerine çalıştı, Fahire Fersan ve Vecdi Seyhun`dan yararlandı, ilgi alanını daha sonra musiki tarihine yöneltti. Abdülbaki Gölpınarlı`dan şarkiyat kaynakları ve metodolojisi alanlarında büyük ölçüde faydalandı, bu arada Türk ve İslam Müziği`nin tarihiyle ilgili kitap, belge, fotoğraf, film ve ses kaydı gibi arşiv malzemesi topladı, geniş bir nota kolleksiyonu oluşturdu.
Türk Müziği Tarihi`yle ilgili çok sayıda araştırması yayınlanan Murat Bardakçı, Hürriyet Gazetesi yazarlarındandır.
Murat Bardakçı Osmanlı İmparatorluğu `nun yıkılış dönemine ilişkin araştırmalarıyla bilinir. Sultan Vahdettin üzerine ``Şahbaba`` kitabını yazmıştır. 2006 yılında Kanal D`de yayınlana `Son Osmanlılar` dizisini de Murat Bardakçı yazmıştır.