Murat Ayaydın (d. 19 Kasım 1965), Türk atlet. Türk atletizminin en iyi yüksek, üç adım ve uzun atlayıcılarındandır. Atletizme 1978 yılında yüksek atlama ile başlamış 1,70'lik boyuna rağmen 2,18 m atlamış, boy-atladığı yükseklik oranı olarak dünyanın sıçrama kapasitesi en yüksek atletleri arasına girmiştir. 1982 yılında, Yunanistan'ın Drama şehrinde yapılan Balkan Gençler Atletizm Şampiyonası'nda ilk kez milli formayı giymiş ve bu yarışta ilk kez 2,00 m atlamıştır.
1985'te 2.06'lık derecesiyle yüksek atlamada ilk Türkiye şampiyonluğuna ulaşmış, 1986 ve 1988'de 2,05'lik dereceleri ile bu başarısını tekrarlamıştır.
Doksanlı yılların başında uzun ve üç adım atlamaya geçerek bu iki branşta da Türkiye rekorlarını ve Türkiye şampiyonluklarını uzun süre elinde bulundurmuştur. Atletizme Galatasaray'da başlamış olan Ayaydın, uzun yıllar bu kulüpte şampiyonluklar yaşamıştır. Daha sonra Fenerbahçe'de forma giymiş ve bu takımın 1989-1999 yılları arasında kesintisiz, daha sonra 2001 ve 2003-2006 arasında Türkiye şampiyonu olmasında, ayrıca Şampiyon Kulüpler Kupası B Grubu'nda 1993'te şampiyon, 1995'te ikinci, 1994 ve 1996 yıllarında ise Avrupa'nın ilk sekiz takımı arasına girmesinde pay sahibi olmuştur.
1990 yılında 7,61'lik derecesiyle uzun atlamada ilk kez Türkiye şampiyonu olmuş, 1991 (7,69 m), 1992 (7,63 m) ve 1993'te (7,33 m) şampiyonluğunu korudu. 1994-2000 arasında Türkiye birinciliğinden uzak kalan Ayaydın, 2001 (7,64 m), 2002 (7,58) ve 2003 (7,63 m) yıllarında üç Türkiye şampiyonluğu daha kazandı.
Üç adım atlamada da uzun yıllar Türkiye şampiyonluğunu bırakmadı. 1988'de 15,41'lik derecesiyle ilk kez bu dalda şampiyon olan Ayaydın, 1989 (15,72 m), 1990 (16,15 m, yüksek rüzgâr), 1991 (15,97 m), 1995 (15,92 m) ve 1997 (16,05 m) yıllarında da birinci oldu.
Uzun yıllar pist ile salon rekorlarını elinde tuttu ve defalarca ay-yıldızlı formayı giydi. Şu anda Ankara'daki Hüseyin Güllüoğlu Ortaöğretim okulunda beden öğretmeni olarak hizmet vermektedir