Morotopithecus bishopi, Uganda, Moroto'nun Miyosen yataklarında keşfedilen bir maymun türüdür.
Morotopithecus bishopi'nin filogenetik statüsü, Miyosen primatları ve mevcut hominidler (yani büyük insansı maymunlar) arasındaki bağlantı olduğu tartışılmaktadır. Filogenetik analize göre, Morotopithecus, mevcut büyük maymunların kardeş taksonu olurken, Hylobatidler (gibongiller) bu dal ortaya çıkmadan önce dallara ayrılmış gibi görünüyor. Bununla birlikte, moleküler genetik çalışmalara göre, gibongillerin 18 milyon yıl önce diğer hominidlerden ayrıldığı düşünülürken, Morotopithecus, yaklaşık 20.6 milyon yıl öncesine tarihlenir.
Morotopithecus ile Afropithecus'un diş özelliklerinin karşılaştırılmasında, sonuçlar çok az fark gösterdi, ayrıca kraniyal karşılaştırmalardan elde edilen kanıtlar da iki cinsin sinonim olabileceğini gösteriyor (Patel, Grossman 2005). Bu arada, Pickford (2002), omurları Ugandapithecus'a yönlendirdi ve Morotopithecus'u Afropithecus ile eşanlamlı olarak kabul etti.