Profesyonel olarak futbola 1994 yılında Slovakya takımı Spartak Trnava`da başlamıştır. 1999 yılında La Liga ekibi Real Betis`e transfer olarak ilk kez yurtdışında bir lige transfer olmuştur. 2000 yılında yönetimi değişen ve tamamen kadrosunu yenileyen Beşiktaş`a transfer olmuştur. Bir sonraki sezon Bundesliga`nın VfL Wolfsburg takımına transfer olmuştur ve halen aynı takımda forma giymektedir.
Karhan, 73 kez Slovakya Milli Futbol Takımı formasını giymiş ve 7 gol atmıştır.
Kariyeri
- 1994/95 - }Spartak Trnava (32/2)
- 1995/96 - }Spartak Trnava (32/6)
- 1996/97 - }Spartak Trnava (26/6)
- 1997/98 - }Spartak Trnava (27/2)
- 1998/99 - }Spartak Trnava (28/5)
- 1999/00 - }Real Betis (33/2)
- 2000/01 - }Beşiktaş JK (25/2)
- 2001/02 - }VfL Wolfsburg (33/3)
- 2002/03 - }VfL Wolfsburg (32/0)
- 2003/04 - }VfL Wolfsburg (32/4)
- 2004/05 - }VfL Wolfsburg (34/1)
- 2005/06 - }VfL Wolfsburg