2003 yılında Ajax'ın B takımını çalıştırmak üzere teklif aldı ve teklifi kabul ederek 2003-2004 yılları arasında Ajax B'yi çalıştırdı. Aslında asıl teklifin Ajax takımından değil Hollanda Milli Takımından geldiği Bir sene sonra anlaşıldı. 2004 yılının Ekim ayında Hollanda Futbol Federasyonu'yla Anlaşarak Hollanda Milli takımını çalıştırmak üzere göreve getirildi. 2006 dünya kupas'nda Portekiz Milli Takımına yenilerek ilk 8 e giremeyen Hollanda Milli takımı Van Basten le yollarına devam etme kararı aldı. 2006 dünya kupasında alınan başarısızlıktan ziyade Marco Van Basten'in en çok eleştiri aldığı konu, Ruud Van Nistelrooy oynatılmamasıydı.
Oynadığı Mevki: Forvet Lakabı: Utrecht Kuğusu Oynadığı Takımlar: Ajax Amsterdam(1982-1987),
AC Milan(1987-1993),
Hollanda Ulusal Takımı(1983-1992)Çalıştırdığı takımlar: Ajax Amsterdam B (2003-2004)
Hollanda Ulusal Takımı(2004-?)