Joel Aguilar (d. 2 Temmuz 1975), Salvadorlu futbol hakemidir. Şu anda San Salvador'da futbol hakemliği yapmaktadır. FIFA'da uluslararası kariyeri 2001'den beri devam etmektedir.
Kanada'dadayken 2007 FIFA 20 Yaş Altı Dünya Kupasından futbol hakemi olarak seçilmiştir. 30 Haziran 2007'de Güney Kore ve Amerika Birleşik Devletleri ile birlikte olan maçta, 5 Temmuz 2007'de Yeni Zelanda ve Gambiya ile birlikte olan maçta, ve 8 Temmuz 2007'de Avusturya ve Şili ile olan maçta futbol hakemliği yapmıştır.
Aguilar 2010 FIFA Dünya Kupası'nda da futbol hakemi olarak seçilmiştir. Ancak bu turnuva sırasında maçlarda oynayamadı.
Aguilar 14 Ocak 2014'te, 2014 FIFA Dünya Kupası'nda FIFA tarafından Brezilya ile oynanacak maçta hakem olarak seçilmiştir.