Friedrich Schiller Üniversitesi Jena (FSU) (Almanca: Friedrich-Schiller-Universität Jena, mezunlarının ifadesiyle Uni Jena), Jena, Türingiya, Almanya'da yer alan bir devlet araştırma üniversitesidir.
Üniversite 1558 yılında kurulmuş Almanya'daki en eski on üniversiteden biridir.Sonuncusu 2000 yılında fizik alanında Nobel kazanan Jena mezunu Herbert Kroemer olmak üzere 6 tane Nobel kazanan ile afiliasyonu vardır. Tarih profesörü olarak 19. yüzyılda Jena'da ders veren ünlü yazar Friedrich Schiller'den sonra üniversiteye yazarın adı verilmiştir.Öğretim üyesi kadrosunda yer alan Karl Leonhard Reinhold, Johann Gottlieb Fichte, G. W. F. Hegel, F. W. J. Schelling ve Friedrich von Schlegel gibi isimlerle üniversite Alman idealizmi ve Alman Romantizmi'nin tam odağında yer almıştır.