Java Denizi (Endonezyaca: Laut Java) Sunda Kayalığı`nda bulunan sığ (derinliği az olan) bir denizdir (310.000 km²). Deniz Endonezya`nın adaları arasında uzanır. Kuzeyde Borneo, güneyde Java, batıda Sumatra ve doğuda Sulawesi bulunur. Güney Çin Denizi`ne bağlı olan Kalimata Boğazı onun kuzeybatısındadır. Balıkçılık Java Denizi`nde önemli bir canlılığa sahiptir. Alanda 3.000`in üzerinde balık türü yaşamaktadır. Bu alandaki mevcut ulusal parklardan biri Karimunjawa`dır. Jakarta anakarasının kuzeyinde Thousand Islands adaları bulunur. Java Sea civarındaki yerler turistik gezi için popülerdir. Scuba dalışı su altı mağara fotoğrafçılığı, gemi enkazı, mercan, sünger ve diğer sahil yaşamını keşfetmek için fırsat sunar.
Java Deniz Savaşı, 2. Dünya Savaşı`nda 1942`nin Şubat ve Mart`ı esnasında olağan üstü donanım savaşları`ndan birine sahne olmuştur. Hollanda, Britanya, Avustralya ve ABD`nin deniz kuvvetleri Java`yı Japonya saldırılarından korumaya çalışırken adayı neredeyse tamamen harap ettiler.