Askeri Tıbbiyeyi Şahane`ye (Askeri Tıp Fakültesi) bitirerek, tabip yüzbaşı oldu. Haydarpaşa Tatbikat Hastanesi`nde çalışırken II. Abdülhamid yönetimine karşı çıktı. Etkinlikleri öğrenilince Rodos Kalesi`ne sürüldü. Buradan kaçarak Paris`e yerleşti. 1897`de Abdullah Cevdet, Edhem Ruhi, Tunalı Hilmi, Ahmed Nuri, Mustafa Ragıp gibi arkadaşlarıyla birlikte Osmanlı İttihat ve Terakki Cemiyeti`nin Cenevre Şubesi`ni kurdu. Osmanlı Gazetesi`ni yayınlamaya başladı. Aynı yıl, cemiyetin Kahire Şubesi`nin kurulmasına da öncülük etti. Hükümet bu çalışmalardan tedirgin oldu. Vazgeçerlerse onlara mesleklerine uygun görevler verileceğini belirtti. İshak Sükuti ve arkadaşları, Trablusgarp`taki 78 siyasi tutuklunun serbest bırakılması karşılığında bu öneriyi kabul etti. İshak Sükuti anlaşma uyarınca Roma Büyükelçiliği`nde doktorluk görevi aldı.
Cemiyet, bu dönemde yayınlarının Londra`da sürdürdü. İshak Sükuti ve arkadaşları imzasız yazılarla bu yayınlara katıldı. Sürgünlük yıllarında vereme yakalanan İshak Sükuti, San Remo`da öldü.