1908 yılında şehrin diğer takımı A.C. Milan ile bölünerek kuruldu. A.C. Milan'dan ayrılmasına sebep takım içindeki başta İsviçreli oyuncular olmak üzere bazı oyuncuların takımdaki İtalyan egemenliğine karçı çıkmaktı. Zaten bu yüzden kuruluşundan beri Inter Milan yabancı oyunculara açıktır ve takımın adı bunu belli eder şekilde Internazionale olarak konulmuştur.
İki dünya savaşı arasındaki zaman dilimi arasında faşist lider Benito Mussolini döneminde takım adını Ambrosiana-Inter olarak değiştirlmeye zorlanmıştır. Ve 1942 ye kadar bu ismi kullanmak zorunda kalmıştır.
Kulüp tarihinin en başarılı dönemini 1963 ile 1966 yılları arasında yaşamış ve bu dönemde üç İtalya Şampiyonluğu ve iki Avrupa Şampiyon Kulüpler Kupası Şampiyonluğu kazanmıştır.
Altın çağı geride bırakırken Inter 11. şampiyonluğunu 1971`de, 12.sini 1980`de kazanmıştır. 13. şampiyonluğunu 1989'da kazanan İnter 14. ve son şampiyomlunu ise 2006 sezonunda yaşamıştır.2006 sezonunda ligi 3. sırada bitirmesine karşılık 1. olan Juventus ve 2. olan A.C. Milan'ın elde ettiği dereceler bu iki takımın şike yaptığı gerekçesiyle iptal edilmiş, böylece İnter uzun süredir hasret kaldığı şampiyonluğa kavuşmuştur. 14 şampiyonluğu bulunan Inter, Juventus (28) ve Milan`ın (17) arkasından 3. sıradadır.
Başarılar
14 İtalyan Şampiyonluğu: 1909/10 , 1919/20 , 1929/30 , 1937/38 , 1939/40 , 1952/53 , 1953/54 , 1962/63 , 1964/65 , 1965/66 , 1970/71 , 1979/80 , 1988/89 , 2005/062 Avrupa Şampiyonluğu: 1963/64 , 1964/65
4 İtalya Kupası: 1938/39 , 1977/78 , 1981/82 , 2004/05
3 UEFA Kupası: 1990/91 , 1993/94 , 1997/98
2 Kıtalarası Futbol Şampiyonası Kupası: 1964 , 1965
2 İtalya Süper Kupası: 1988/89 , 2005/06
Bunların dışında 2 Avrupa Şampiyon Kulüpler Kupası finali, 1 kez de UEFA finali oynamıştır.