Escherichia
İngilizce Escherichia kelimesinin İspanyolca karşılığı.s. especie de bacteria de intestino
Escherichia (Eşerikya okunur), enterobakteriler (Enterobacteriaceae) familyasında bir bakteri cinsidir. Bu cinsin en ünlü üyesi olan ``E. coli`` araştırmacılar tarafından çok ayrıntılı olarak incelenmiş bir model organizmadır. ``Escherichia`` türleri Gram-negatif, spor oluşturmayan, seçmeli anaerob, çubuk şekillidir. Çoğu sıcak kanlı hayvanın bağırsaklarında yaşar.
``Escherichia`` cinsinin tanımlanmış ilk türü olan ``Escherichia coli``, Theodor Escherich tarafından yeniden doğmuş bebeklerin dışkılarından izole edilmiştir (1885). Uzun yıllar bu türün zararsız bir bakteri olduğu düşünüldüyse de 1935`te bir bebek kreşindeki ishal salgınına bir ``E. coli`` suşunun neden olduğu gösterilmiştir.
Enterobakteri familyası 1937`de tanımlandığı zaman bu familyanın tip cinsi olarak ``Escherichia`` seçilmiştir.
Escherichia türleri
Çoğu ``Escherichia`` türü zararsız komensal bakteriler olmalarına karşın aralarında insan için hastalık oluşturucu (patojen) olanları da vardır. ``E. coli``, ``Escherichia`` türlerinin neden olduğu hastalıkların en başlıca sorumlusudur, basit ishalden dizanteri benzeri vakalara kadar uzanan önemli bağırsak hastalıklarına neden olabilir. İdrar yolu hastalıklarının büyük bir çoğunluğu da ``E. coli`` tarafından meydan gelir. Ancak, bu cinsin diğer üyelerinin de insan hastalıklarında rol oynadıkları gösterilmiştir.Pien FD, Shrum S, Swenson JM, Hill BC, Thornsberry C, Farmer JJ 3rd (1985). "Colonization of human wounds by Escherichia vulneris and Escherichia hermannii". J Clin Microbiol 22 (2): 283-5. [1]Chaudhury A, Nath G, Tikoo A, Sanyal SC (1999). "Enteropathogenicity and antimicrobial susceptibility of new Escherichia spp". J Diarrhoeal Dis Res 17 (2): 85-7.[2] ``Escherichia`` cinsi içinde ``E. coli`` dışında türler (``E. adecarboxylata``, ``E. blattae``, ``E. fergusonii``, ``E. hermanii`` ve ``E. vulneris``) biyokimyasal olarak tanımlanmışlardır ancak bunların dağılımları, biyolojileri ve birbirlerine olan yakınlıkları hakkında halen çok az şey bilinmemektedir.Diğer enterobakterilerle ilişkisi
``Eschrichia`` `nın diğer cinslerden farklılığı DNA analizleri ile gösterilmiş, DNA dizin ilişkilerine dayanarak ``Escherichia`` ve ``Shigella`` cinslerinin birbirlerine çok yakın bir grup oluşturdukları, bu gruba en yakın enterobakteri grubunda ise ``Citrobacter``, ``Enterobacter``, ``Klebsiella`` ve ``Salmonella`` olduğu saptanmıştır.``Escherichia``, ``Shigella`` `dan farklı olarak laktoz fermantasyonu yapabilir ve lizin amino asidini dekarboksile edebilir. Genelde tüm ``Shigella`` türleri hastalık yapmasına karşın ``Escherichia coli`` `nin yalnızca bazı serotipleri bağırsak enfeksiyonuna yol açar. Bu farklılıklara rağmen DNA analizleri iki organizmanın büyük bir benzerlik gösterdiğini bulunmuş, ``Escherichia`` ve dört ``Shigella`` türünün aslında tek bir tür oluşturacak kadar benzer oldukalri gösterilmiştir. Patojen olan ve olmayan bazı ``E. coli`` türleri arasındaki farklılık, bazı patojen ``E.coli`` türleri ile ``Shigella`` türleri arasındaki farklılıktan daha fazladır. Bu bulgulara rağmen ``Escherichia`` ve ``Shigella`` türleri, patojen olma potansiyellerindeki farklılıktan dolayı ayrı sınıflandırılmaya devam edilmektedir.
Patojenik olmayan ``E. coli`` ile patojen olan ``Shigella flexneri`` `nin genomları yalnızca birkaç noktada farklılık gösterirler. ``S. flexneri`` `nin virülans genlerinin çoğu bir plazmidde yer alır. ``Salmonella enterica`` türünün de genomu ``E. coli`` `ninkine çok benzer ama genomun içindeki iki "genetik ada" pek çok virülans geni bulundurur. Klasik biyokimyasal yöntmelerle tanımlanmış olan bu üç tür, günümüz genetik yöntemlerle aynı cins, hatta aynı türün üyeleri sayılabilecek kadar birbirlerine yakındırlar. Genetic differences between pathogens and nonpathogens. in: The Molecular Biology of the Cell. Albers et al. [3]