| kanal = Star TV | ilk_gösterim = 13 Kasım 2011 | son_gösterim = 17 Haziran 2012 | bölüm_sayısı = 31 | önceki_sezon = 1.sezon | sonraki_sezon = 3.sezon | bölün_listesi = Behzat Ç. Bir Ankara Polisiyesi bölümleri listesi }} Dizi kadrosuna narkotik komiseri Suna rolünde Mine Tugay, psikolog Funda rolünde Yasemin Öztürk ve cinayet eski başkomiseri Aziz rolünde Ahmet Uğurlu dahil olmuştur. Dizinin ikinci sezonu 39. bölümüyle 13 Kasım 2011'de başlamıştır. Sezonun ilk bölümlerinde Esra, Harun, Akbaba, Hayalet, Cevdet, Eda ve Şevket, Ercüment'in tuzağına düşen Behzat'ı hapise düşmekten kurtarmak için uğraşırlar ve başarılı olurlar. Cinayetin Behzat'ın üzerine yıkıldığı ortaya çıktı. Fakat Behzat bunu da atlatmayı başarmış ve mesleğine sezonun ilk bölümlerinde geri dönmüştür. Behzat bu sezonda kızının katilinin diğer kızı olduğunu öğrendiği için bu gerçekle yaşamaya devam edecektir. Bir yandan kendisinin yokluğunda ekip tarafından faili meçhule bırakılan cinayetleri çözecek, bir yandan Aziz Başkomiserin yürüttüğü Kesik Parmak Cinayetleri' nin katilini bulacak ve bir yandan da dizide işlenen cinayetler ile ilgilenecektir. Ayrıca bu sezonun ilk bölümlerinde Savcı Esra'nın dizi boyunca bahsi bile geçmeyen, eskiden beri görüşmediği kardeşi Savaş diziye dahil olmuştur. Savaş, başına buyruk bir gençtir, bilgisayar mühendisliğini son sınıfta terk etmiştir. Şevket'in müdürü olduğu alışveriş şirketinde işe girer. Savcı Esra ile aralarında husumet vardır. Savaş geçmişte bir suç işlemiştir, Esra'ya da bu suçtan kendisini kurtaramadığı için kırgındır. Daha sonradan aralarındaki sorunları hallederler. Behzat ise tek başına kaldığı zamanlarda 5-6 tane Behzat ile sesli düşünmektedir. Daha sonradan Kesik Parmak Cinayeti'nin günümüzdeki katilinin Suna olduğunu öğrenen Aziz, Suna'ya yardım etmeye başlar. Ekibin ise özel hayatları değişime girmiştir. Behzat, Savcı Esra ile evlenir. Şule'yi de artık kızı olarak kabul eder ve herkese teker teker bunu açıklamaya koyulur. Üç kişi bir aile olarak Savcı Esra'nın evinde yaşamaya başlar. Harun ve Eda ise Harun'un teklifi üzerine çıkmaya başlarlar. Akbaba ise daha önceden kimsenin bilmediği babası ile hesaplaşmaya kalkar. Hayalet ise Ilgın ve Elif arasında kararsızdır. Şevket ise boşanmak istememekte fakat Funda'yı da sevmektedir. Şevket; aynı zamanda Savaş ve Şule'nin arasını yapmaya çalışmaktadır. Şevket daha sonra boşanır ama Funda'nın ajan olduğunu öğrenir. Zaten daha sonra Funda öldürülür. Bu sezon dizinin ana iskeletini oluşturan ve 15 yıl önceki cinayetlerin kopyası olan kesik parmak cinayetlerinin katili ise Suna olduğu ortaya çıkar. Suna öldürdükleri adamların bazı kızları tuzağa düşürdüklerini ve bu kızları kötü emellerine alet ettikleri için, bütün acı çeken ve öldürülen kadınlar için işlediğini söyler ve intihar eder. Gazeteci Elif ise bunu haber yapmak ister ama izin verilmez. Elif ise bunu roman olarak yazmaya karar verir. Eski Kesik Parmak Cinayetleri'nin katili ise Cevdet tarafından bulunur. Fakat Cevdet bunu Hayalet dışında kimseye söyleyemez. Fakat daha sonradan Aziz Başkomiser katili bulur. Katil Akbaba'dır. Ercüment Çözer ise Avrupa'dan fırtına gibi döner. İhale soruşturması ile hala uğraşan Esra'yı önce içeri tıktırır. Savcı Esra ise sezon finalinde ölür. Ercüment Çözer ve Memduh Başgan ise tüm şüpheyi üzerine çeker.Ayrıca sezon finalinde Bahri'nin Anne'ye çalıştığını öğrenmiş oluruz. Dizinin 2.sezonu,13 Kasım 2011 tarihinde yayınlanan 39.bölümü ile başlayıp,17 Haziran 2012 tarihinde yayınlanan "Akıntıya Karşı..." isimli 69.bölümü ile tamamlanmıştır. Sezon içinde kadroya dahil olan karakterler * Aziz (Ahmet Uğurlu) * Suna (Mine Tugay) * Funda (Yasemin Öztürk) * Bahri (Emre Elçil) Sezon içinde kadrodan çıkarılan karakterler * Abi (Zafer Algöz) * Funda (Yasemin Öztürk) * Suna (Mine Tugay) * Aziz (Ahmet Uğurlu) * Esra (Canan Ergüder)