Bandırma Körfezi, Marmara Denizi'nin güneyinde bulunan körfez. Kapıdağ Yarımadası'nın doğu kısmını kapsar. Adını kıyısında bulunan Bandırma yerleşiminden alır.
Yakın zamanlara kadar ada durumunda olan Kapıdağı Yarımadası kıyı kordonları ile karaya bağlanarak oluşmuştur. Ada ile Bandırma arası kapandığında kalan deniz parçası körfez haline gelmiştir. Kapıdağı Yarımadası'nın batı tarafında Erdek Körfezi oluşmuştur.
Kuzey Anadolu Fay Hattı Geyve-Gemlik arasında morfolojik koridor oluşturur. 150 km uzunluğundaki hattın Marmara Denizi'ndeki devamı Bandırma ve Gemlik Körfezleridir. Çek-ayır havzalarında Gemik ve Bandırma çukurlukları oluşmuştur.
Kış mevsiminde kuzey rüzgarları ve İstanbul Boğazı'ndan gelen sular Marmara Denizi'nin yüzey sıcaklığını düşürür. Bandırma körfezi korunmuş durumundan dolayı örneğin Gemlik Körfezinden 0,8 °C daha sıcaktır.
Körfez kıyısındaki en büyük yerleşim Balıkesir ili, Bandırma ilçesidir. Körfezin kuzeydoğu yününde üç küçük ada bulunur. Körfez 2013 yılında Çevre Bakanlığı tarafından kirliliğe karşı hassan bölge ilan edilmiştir.