İlk olarak yangını Westminster`da çıkardığını öne süren Hubert`in iddiaları, yangın Westminster`a sıçramamış olduğu ciddiye alınmadı. Hubert yangının Pudding Sokağı`ndaki ekmek fırınında çıktığunı öğrenince hikayesini bu yönde değiştirmiş ve mahkum edilmiştir. Hubert ``Katoliklerin Fransız casusu`` diye adlandırılmıştır.
28 Eylül 1666 tarihinde Londra`nın Tyburn semtinde asılarak idam edilmiş ve cesedi ibretialem için sallandırılmıştır. İncelemek için Hubert`in cesedi almaya gelen resmi görevliler cesedin yangın mağduru Londralılarca parçalanmış olduğunu gördüler. [1] "The manner in which the Londoners who watched the execution of Hubert tore his body to pieces as it was about to be handed to the beadle of the Worshipful Company of Barber Surgeons for dissection bears witness to the hatred that the fire had aroused."
