1859’da Meclis-i Vala Başkanlığına tayin olundu. 1861 yılında bu görevden ayrıldı. 1864 yılında vefat ederek Eyüp Sultan Kabristanında defnedildi.
Adaletli ve hayırseverliğiyle tanınan Musa Safveti Paşa, Karaköy Hüseyinağa mahallesinde bir Nakşibendi dergahı, cami ve kütüphane, Yenikapı’da Osman Reis Camii bitişiğinde bir çeşme yaptırdı. Şam valiliği esnasında tanışıp görüştüğü Mevlana Halid-i Bağdadi hazretlerinin halifesi Muhammed bin Abdullah el-Hani’yi (v. 1862) İstanbul’a davet ederek evinde misafir etmiş, Sultan Abdülmecid Hanla tanıştırıp çeşitli devlet adamları ile görüştürmüştür. Musa Safveti Paşa ayrıca Sirkeci Ebüssü’ud caddesinde kendi adıyla yaptırdığı mescit ve tekkeyle İstanbul’da Üçüncü Halidiye Dergahının kurulmasını sağlamıştır. Bu mescit ve tekke, bugün ilkokul olarak kullanılmaktadır.
