Brezilya takımı Palmeiras`dan 1958 yılında AC Milan`a transfer olarak İtalya`daki futbol yaşantısına başladı. 1965 yılında Napoli`ye transfer olana kadar Milan`da başarı ile forma giydi ve iki şampiyonluk yaşadı. Milan`da attığı 160 gol rekoru uzun süre kırılamadı. 1965 yılında SSC Napoli`ye transfer oldu.
1973`de Juventus`a transfer oldu. Bu takımda da 1973 ve 1975 yıllarında iki şampiyonluk yaşadı. Kariyerin son yıllarında İsviçre liglerinde oynadı.
Altafini, ardarda iki farklı FIFA Dünya Kupası`nda farklı ülkelerin formasını giyen ender oyunculardandır. 1958`de Brezilya`da oynarken, 1962`de İtalya adına kupaya katılmıştır.
